Общая численность байкальского омуля, зашедшего в нерестовые реки в 2011 году, составила 3,6 млн. экземпляров, что на 0,8 млн. ниже среднемноголетнего уровня. Как сообщает министерство природных ресурсов и экологии РФ, на реке Верхняя Ангара была зафиксирована самая низкая за последние 30 лет численность нерестового омуля. В реку Баргузин, напротив, зашло рекордное количество омуля - 0,6 млн. голов.
По данным минприроды, запасы промысловых рыб в Байкале остаются стабильными. Общие допустимые уловы омуля, сига и хариуса в 2010-2012 годах менялись незначительно. Рекомендованный вылов мелкого частика (плотва, елец, окунь, карась) в 2011 году был выше уровня 2010 года на 214 тон.
Байкальская нерпа у ученых опасений не вызывает. Общая численность популяции в 2011 году осталась на высоком уровне - 95 тыс. голов. Величина допустимой годовой добычи нерпы составляет 5-6 тыс. штук.